สถาบันถ่ายทอดเทคโนโลยีสู่ชุมชน และสถาบันวิจัยเทคโนโลยีเกษตร เป็นหน่วยงานที่ได้รับมอบหมายให้ดูแล ดำเนินการ การติดตามความก้าวหน้า และสนับสนุนงาน โครงการอันเนื่องมาจากพระราชดำริฯ
ศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิริ โดยตั้งแต่ปี 2561 เป็นต้นมา ศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิริ มีเป้าหมายการดำเนินผลิตพืชในแนวทางเกษตรอินทรีย์ โดยมีเป้าหมายในการลดการใช้สารเคมีเกษตร ให้ได้
100 เปอร์เซ็นต์
โดยในปี 2564 มหาวิทยาลัยได้ร่วมดำเนินการในโครงการพัฒนาพันธุ์พืชที่มีคุณภาพ โครงการผลิตเมล็ดพันธุ์ โครงการบริหารจัดการศัตรูพืชในศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิริ และโครงการผลิตมะเขือเทศและแตงกวาผลสดทั้งปีในพื้นที่ศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิริ จึงมีการดำเนินโครงการเพื่อเตรียมความพร้อมด้านพื้นที่ สำหรับการปรับปรุงพันธุ์ การผลิตเมล็ดพันธุ์และการผลิตพืชในแนวทางเกษตรอินทรีย์ ดำเนินการบริหารจัดการศัตรูพืชโดยการสำรวจ และใช้ชีวภัณฑ์ควบคุมโรคและแมลงเพื่อให้การดำเนินงานโครงการเป็นไปตามเป้าหมายของศูนย์พัฒนาพันธุ์พืชจักรพันธ์เพ็ญศิริได้อย่างมีระบบ